Als u in bezit bent van een Nederlands paspoort moet u ook als u alleen een overstap of doorvlucht (laatstgenoemde alleen in enkele gevallen) maakt in Canada over een eTA beschikken. Dus zelfs als u het toestel niet verlaat dient u, afhankelijk van de eindbestemming, te beschikken over een eTA. Al tijdens het inchecken van uw eerste vlucht wordt u gevraagd of u beschikt over een geldig reisdocument.
Bij zowel een overstap als doorvlucht dient u dus een eTA aan te vragen alvorens u aan de reis begint. De vereisten zijn hetzelfde als voor een reguliere eTA aanvraag. U hoeft echter niet voor elke overstap of doorvlucht een aparte eTA aan te vragen; een toegekende eTA is in principe voor 5 jaar geldig zonder een maximum aantal reizen. Ook als u eerst een reis maakt met een zakelijk doeleinde en vervolgens een toeristische reis maakt hoeft u geen nieuwe eTA aan te vragen.